Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM32Q13049 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM32Q13049 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM32Q13049 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM32Q13049 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM32Q13049 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM32Q13049 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms