Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRN3Q13033 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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