Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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