Protein–RNA interactions for Protein: Q12046

CWC2, Pre-mRNA-splicing factor CWC2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CWC2Q12046 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
CWC2Q12046 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
CWC2Q12046 ATP8Q0080 147 nt0.65□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 CSE1YGL238W 2883 nt0.65□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 YNL170WYNL170W 396 nt0.63□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.62□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 UTP20YBL004W 7482 nt0.61□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 Q0092Q0092 141 nt0.61□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 SBH1YER087C-B 249 nt0.61□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 RCO1YMR075W 2055 nt0.6□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 YMR160WYMR160W 2451 nt0.6□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 YNL205CYNL205C 423 nt0.59□□□□□ -2.31
CWC2Q12046 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.58□□□□□ -2.32
CWC2Q12046 SOM1YEL059C-A 225 nt0.58□□□□□ -2.32
CWC2Q12046 UTP10YJL109C 5310 nt0.58□□□□□ -2.32
CWC2Q12046 ORC3YLL004W 1851 nt0.57□□□□□ -2.32
CWC2Q12046 MLP2YIL149C 5040 nt0.57□□□□□ -2.32
CWC2Q12046 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.55□□□□□ -2.32
CWC2Q12046 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.55□□□□□ -2.32
CWC2Q12046 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.52□□□□□ -2.33
CWC2Q12046 BIR1YJR089W 2865 nt0.51□□□□□ -2.33
CWC2Q12046 YOL014WYOL014W 375 nt0.51□□□□□ -2.33
CWC2Q12046 YBR099CYBR099C 384 nt0.51□□□□□ -2.33
CWC2Q12046 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.5□□□□□ -2.33
CWC2Q12046 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.49□□□□□ -2.33
CWC2Q12046 PMP2YEL017C-A 132 nt0.48□□□□□ -2.33
CWC2Q12046 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.47□□□□□ -2.33
CWC2Q12046 FMP27YLR454W 7887 nt0.44□□□□□ -2.34
CWC2Q12046 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.44□□□□□ -2.34
CWC2Q12046 snR69snR69 101 nt0.44□□□□□ -2.34
CWC2Q12046 YNL266WYNL266W 420 nt0.43□□□□□ -2.34
CWC2Q12046 SEC10YLR166C 2616 nt0.42□□□□□ -2.34
CWC2Q12046 EST1YLR233C 2100 nt0.41□□□□□ -2.34
CWC2Q12046 AI1Q0050 2505 nt0.39□□□□□ -2.35
CWC2Q12046 RDS3YPR094W 324 nt0.36□□□□□ -2.35
CWC2Q12046 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.35□□□□□ -2.35
CWC2Q12046 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.33□□□□□ -2.36
CWC2Q12046 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.32□□□□□ -2.36
CWC2Q12046 YBR178WYBR178W 375 nt0.32□□□□□ -2.36
CWC2Q12046 THO2YNL139C 4794 nt0.3□□□□□ -2.36
CWC2Q12046 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.29□□□□□ -2.36
CWC2Q12046 ESP1YGR098C 4893 nt0.29□□□□□ -2.36
CWC2Q12046 SOV1YMR066W 2697 nt0.25□□□□□ -2.37
CWC2Q12046 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.23□□□□□ -2.37
CWC2Q12046 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.23□□□□□ -2.37
CWC2Q12046 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.21□□□□□ -2.38
CWC2Q12046 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.19□□□□□ -2.38
CWC2Q12046 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.16□□□□□ -2.38
CWC2Q12046 Q0143Q0143 153 nt0.14□□□□□ -2.39
CWC2Q12046 snR61snR61 90 nt0.12□□□□□ -2.39
CWC2Q12046 snR128snR128 126 nt0.12□□□□□ -2.39
CWC2Q12046 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.09□□□□□ -2.4
CWC2Q12046 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.09□□□□□ -2.4
CWC2Q12046 snR50snR50 90 nt0.08□□□□□ -2.4
CWC2Q12046 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.03□□□□□ -2.4
CWC2Q12046 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.02□□□□□ -2.41
CWC2Q12046 snR81snR81 201 nt0□□□□□ -2.41
CWC2Q12046 snR85snR85 171 nt0□□□□□ -2.41
CWC2Q12046 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0□□□□□ -2.41
CWC2Q12046 snR45snR45 172 nt0□□□□□ -2.41
CWC2Q12046 snR67snR67 82 nt-0.02□□□□□ -2.41
CWC2Q12046 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.03□□□□□ -2.41
CWC2Q12046 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.06□□□□□ -2.42
CWC2Q12046 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.09□□□□□ -2.42
CWC2Q12046 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.1□□□□□ -2.43
CWC2Q12046 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.11□□□□□ -2.43
CWC2Q12046 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.11□□□□□ -2.43
CWC2Q12046 YMR326CYMR326C 309 nt-0.15□□□□□ -2.43
CWC2Q12046 SKI7YOR076C 2244 nt-0.18□□□□□ -2.44
CWC2Q12046 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.2□□□□□ -2.44
CWC2Q12046 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
CWC2Q12046 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.22□□□□□ -2.44
CWC2Q12046 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.23□□□□□ -2.45
CWC2Q12046 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.24□□□□□ -2.45
CWC2Q12046 YHR217CYHR217C 462 nt-0.24□□□□□ -2.45
CWC2Q12046 snR47snR47 99 nt-0.28□□□□□ -2.45
CWC2Q12046 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.28□□□□□ -2.45
CWC2Q12046 RPL41AYDL184C 78 nt-0.29□□□□□ -2.46
CWC2Q12046 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.31□□□□□ -2.46
CWC2Q12046 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.31□□□□□ -2.46
CWC2Q12046 snR38snR38 95 nt-0.32□□□□□ -2.46
CWC2Q12046 snR62snR62 100 nt-0.33□□□□□ -2.46
CWC2Q12046 YBL109WYBL109W 336 nt-0.34□□□□□ -2.46
CWC2Q12046 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.4□□□□□ -2.47
CWC2Q12046 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.42□□□□□ -2.48
CWC2Q12046 snR161snR161 161 nt-0.43□□□□□ -2.48
CWC2Q12046 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.44□□□□□ -2.48
CWC2Q12046 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.5□□□□□ -2.49
CWC2Q12046 snR33snR33 183 nt-0.52□□□□□ -2.49
CWC2Q12046 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.53□□□□□ -2.49
CWC2Q12046 YKL225WYKL225W 348 nt-0.54□□□□□ -2.5
CWC2Q12046 URB1YKL014C 5295 nt-0.54□□□□□ -2.5
CWC2Q12046 snR77snR77 88 nt-0.56□□□□□ -2.5
CWC2Q12046 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.59□□□□□ -2.5
CWC2Q12046 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.6□□□□□ -2.51
CWC2Q12046 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.63□□□□□ -2.51
CWC2Q12046 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.63□□□□□ -2.51
CWC2Q12046 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.64□□□□□ -2.51
CWC2Q12046 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.3 ms