Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms