Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4F3Q08477 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms