Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLEQ07864 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLEQ07864 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLEQ07864 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLEQ07864 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLEQ07864 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLEQ07864 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms