Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms