Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP7AQ04656 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms