Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms