Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms