Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms