Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HDLBPQ00341 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms