Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTD2P86397 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTD2P86397 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTD2P86397 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTD2P86397 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTD2P86397 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTD2P86397 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTD2P86397 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTD2P86397 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTD2P86397 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTD2P86397 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms