Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC5P78333 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC5P78333 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC5P78333 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC5P78333 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC5P78333 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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