Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms