Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2FP61218 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 779.2 ms