Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1P60507 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms