Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK1P57059 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SIK1P57059 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK1P57059 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK1P57059 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK1P57059 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK1P57059 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms