Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC4P56524 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC4P56524 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms