Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP6P55212 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP6P55212 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP6P55212 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP6P55212 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP6P55212 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP6P55212 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP6P55212 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP6P55212 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP6P55212 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP6P55212 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP6P55212 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP6P55212 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP6P55212 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP6P55212 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP6P55212 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms