Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP7P55210 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP7P55210 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP7P55210 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP7P55210 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP7P55210 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP7P55210 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP7P55210 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP7P55210 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP7P55210 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP7P55210 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP7P55210 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP7P55210 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP7P55210 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP7P55210 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP7P55210 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP7P55210 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP7P55210 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP7P55210 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP7P55210 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms