Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms