Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A2P52657 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms