Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms