Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNA2P51530 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNA2P51530 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNA2P51530 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms