Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms