Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK7P50613 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK7P50613 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK7P50613 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK7P50613 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK7P50613 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK7P50613 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK7P50613 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK7P50613 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms