Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU3F4P49335 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms