Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX1P48742 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX1P48742 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX1P48742 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX1P48742 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX1P48742 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms