Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTDSS1P48651 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms