Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX5P48382 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX5P48382 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX5P48382 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX5P48382 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX5P48382 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX5P48382 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX5P48382 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX5P48382 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX5P48382 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX5P48382 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFX5P48382 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFX5P48382 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFX5P48382 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX5P48382 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX5P48382 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX5P48382 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX5P48382 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX5P48382 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX5P48382 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX5P48382 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX5P48382 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX5P48382 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX5P48382 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms