Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
REG1BP48304 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
REG1BP48304 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms