Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms