Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOP2P46087 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOP2P46087 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOP2P46087 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NOP2P46087 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP2P46087 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP2P46087 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP2P46087 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms