Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms