Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND3P30281 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND3P30281 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND3P30281 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND3P30281 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND3P30281 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms