Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARCKSP29966 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms