Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms