Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTGFP29279 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTGFP29279 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTGFP29279 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTGFP29279 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTGFP29279 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTGFP29279 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTGFP29279 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTGFP29279 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTGFP29279 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTGFP29279 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTGFP29279 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTGFP29279 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTGFP29279 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms