Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms