Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTX3P26022 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTX3P26022 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTX3P26022 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTX3P26022 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTX3P26022 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTX3P26022 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTX3P26022 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTX3P26022 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms