Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms