Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT1P21579 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT1P21579 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT1P21579 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT1P21579 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT1P21579 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT1P21579 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT1P21579 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms