Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms