Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B1P20020 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms