Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCLP19338 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCLP19338 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCLP19338 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCLP19338 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NCLP19338 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCLP19338 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCLP19338 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCLP19338 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCLP19338 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCLP19338 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCLP19338 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms