Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHCEP18577 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHCEP18577 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHCEP18577 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHCEP18577 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHCEP18577 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHCEP18577 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHCEP18577 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHCEP18577 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHCEP18577 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHCEP18577 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHCEP18577 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHCEP18577 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHCEP18577 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHCEP18577 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHCEP18577 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHCEP18577 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHCEP18577 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHCEP18577 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms