Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT1P17948 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT1P17948 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT1P17948 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT1P17948 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT1P17948 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLT1P17948 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FLT1P17948 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FLT1P17948 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FLT1P17948 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FLT1P17948 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FLT1P17948 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLT1P17948 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLT1P17948 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLT1P17948 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLT1P17948 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FLT1P17948 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLT1P17948 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLT1P17948 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLT1P17948 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLT1P17948 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FLT1P17948 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLT1P17948 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FLT1P17948 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms