Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPI1P17947 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPI1P17947 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPI1P17947 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPI1P17947 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms